Het bestuur is verantwoordelijk voor het beleid, financieel beheer, en de interne en externe communicatie. 

Stichting Younes heeft thans een bestuur bestaande uit 3 personen; een voorzitter, een secretaris en een penningmeester. Zowel in de statuten als in het beleidsplan is opgenomen dat bestuursleden voor hun werkzaamheden geen beloning genieten.